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    临床医学系设有临床医学和康复治疗技术两个专业,两个专业均为省级特色专业。临床医学专业分出有医学影像专业。
    临床医学专业从2008年起在全省三年制临床医学专业中率先开展“1+1+1”人才培养模式的改革(第一年在学校上医学基础课程;第二年在附属医院上医学专业课程;第三年在实习医院实习)。康复治疗技术专业是依托省运动医学会等行业支持开办的新兴专业,该专业2011年被安徽省教育厅立项为“卓越康复技师培养创新实验区”。
    临床医学系共有专任教师34人,附属医院教师200余人。其中教授3人,高级职称的教师占教师总数的41%,其中硕士以上学历占44%。有省级专业带头人1人,校级专业带头人1人。临床医学专业师资队伍是省级“教学团队”。
    临床医学系有临床技能实训中心、康复治疗实训中心和影像实实训中心。临床技能实训中心和康复治疗实训中心均为“省级实训中心”建设项目。中心管理科学、设备先进,每年承担安徽省全科医生培训中心全科医生的培训、考核与大赛多项。临床医学系具有附属医院5所,实习医院20余所。每年就业率均在95%以上。
    临床医学系教师担任国家级和省级规划教材主编及副主编教材20余部,参编了30余部,编写辅导教材4本;近5年教师发表了教科研论文论著共60余篇;获省级教学成果一等奖1次,二等奖3次,三等奖多次。
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